Служба охраны уголовно-исполнительной системы как самостоятельное подразделение образовалось 30 июня 1994 года. В этот день по приказу МВД РФ № 222 функции по охране исправительных учреждений были переданы от внутренних войск МВД отдельным ротам по охране учреждений СИД и СР МВД РФ. За 24-летнюю историю служба охраны стала современным модернизированным подразделением, оснащенным современными инженерно-техническими средствами и выполняющим задачи по обеспечению надежной изоляции осужденных и следственно-арестованных лиц и охраны объектов УИС, укомплектованным подготовленными кадрами.